滨州医学院教育发展基金会是在山东省民政厅登记成立的非公募基金会，于2019年5月8日正式挂牌运行，业务主管单位是山东省教育厅。英文名称为：Binzhou Medical University Education Development Foundation，缩写为BMUEDF。本基金会的宗旨为：加强本单位与社会各界的联系和合作，凝聚各方力量，推动教育事业的发展。本基金会公益活动的业务范围：资助学校重点课程、学科和实验室建设，资助国内外学术研究与交流活动，按照捐赠者的意愿，在教育行政主管单位的指导下，设立奖学金、助学金及救助金，奖励和资助在教育、教学及教育事业中做出突出贡献的人员。

2021年7月，省民政厅组织专家组对学校基金会开展现场检查，从党建引领、内部治理等5方面进行综合评价。经省民政厅最终审核确认，学校基金会荣获4A等级，为提升基金会服务能力和社会公信力发挥了重要作用。